Al igual que su predecesor, Nova 2 requiere que el jugador guíe uno o varios haces de luz hacia un punto determinado. Para manipular el rayo, se pueden colocar diferentes baldosas en el campo de juego, entre ellas: baldosas que cambian la dirección del rayo en 90 grados, bloques que no pueden ser penetrados, bloques que son destruidos por la luz y la ralentizan durante un momento, tubos que impiden que el rayo sea bloqueado por otro rayo, y "burbujas" que rompen la luz y la envían en dos direcciones diferentes. Aunque la jugabilidad sigue siendo la misma, el número de fases se ha incrementado considerablemente, ya que hay seis niveles con 32 fases cada uno. También se incluye un editor de niveles.
