Drake Snake and the Secret Crypt es un juego de plataformas en el que el jugador controla al epónimo Drake, que llegó a África con la esperanza de encontrar un tesoro. Su avión se estrella en medio de la selva y Drake se encuentra dentro de un complejo de cuevas.
Drake explora los 13 niveles de cavernas subterráneas e intenta encontrar la salida mientras evita o mata a los enemigos que hay dentro. Las criaturas enemigas son plantas devoradoras de hombres, arañas, pájaros y escorpiones. Algunos enemigos matan a Drake al instante, mientras que otros simplemente le quitan la salud (por no mencionar que la salud de Drake disminuye lentamente de forma constante). Las principales bazas de Drake son: su mochila propulsora, que le permite volar (pero tiene combustible limitado), una pistola (con munición limitada) y bombas que pueden colocarse en el suelo. Algunas paredes pueden volarse con bombas.